Arbeidsbeskrivelse

 

Ansvar

 

Fagbioingeniør faggruppe II, har ansvar for vedlikehold av denne prosedyren. Alle som er opplært i Vibrio spp., Shewanella spp., Aeromonas spp. og Plesiomonas shigelloides har ansvar for å følge denne prosedyren.

 

HMS/sikkerhetsinformasjon

 

Fæcesprøver SKAL såes ut i sikkerhetsskap

Benytt hansker og smittefrakk ved utsåing av prøver og spredning av selenitt. Selenitt er giftig ved innånding. Jobb i sikkerhetsskap. Etterarbeid SKAL gjøres i avtrekksskap.

 

Arbeidets gang

 

Prøvematerialet og bearbeidelse av dette

 

Fæces bør helst tas på Cary Blair medium når prøve sendes fra primærhelsetjenesten og sykehuset Namsos. Hvis prøven er innsendt på glass uten preservering, se prosedyre: ALM-MM-Fæces; Vurdering, innlapping og primærutsæd av fæcesprøver

for kommentarer som skal være med til rekvirenten.

Analyseutstyr og klargjøring av disse

 

Se EQSID: {{EQSDocument 6318}}

 

Feilkilder og interferens

 

·         For lang transporttid til laboratoriet.

·         For lav eller for høy temperatur under inkubering.

I helger/høytider, dersom det ikke blir tid til å vurdere skålene, skal skålene settes i kjøleskap etter 1 døgns inkubasjon. Skålene pakkes da i plastpose.

 

Fremgangsmåte/Utførelse av analysen

 

Alt etterarbeid med funn av bakterier som mistenkes å være Vibrio spp., Shewanella spp., Aeromonas spp. eller Plesiomonas shigelloides skal utføres i godkjent sikkerhetskabinett klasse 2.

 

Videre arbeid:

Det benyttes ikke selektive skåler for påvisning av disse agens, men de kan vokse på SS/XLD eller CIN agar. Dersom funn av disse ved ID på suspekte koloner skal det jobbes videre med renspredning her.

 

Følsomhetsbestemmelse

 

For følsomhets.best. av Vibrio spp. og Shewanella spp.: konferer mikrobiolog

 

v  Medium: MH-agar.

v  0,5 MacFarland i NaCl.

v  Lappediffusjon.

 

Følsomhetsbestemmelse skal gis ut i disse tilfellene (gjelder for alle funn):

ü  Etter ønske fra rekvirent.

ü  Nye funn fra innlagte pasienter i sykehus og sykehjem

ü  Immunkompromitterte.

ü  Funn hos barn < 2 måneder.

ü  Funn fra blodkultur.

ü  Gravide. Konferer mikrobiolog.

 

For Plesiomonas shigelloides benyttes brytningspunkter for Enterobacterales fra NordicAst.

 

Enterobacterales
Antibiotika	Lappediffusjon
Ampicillin	M1
Amoksicillin-klavulansyre	M2 og M1 barn<12
Piperacillin-tazobactam	M1
Cefuroxime	M1
Cefotaxime	M1 (MS)
Aztreonam	M1
Trimetoprim-sulfametoksazol	M1
Gentamicin	M1
Ceftazidim	M2 (MS)
Ciprofloksacin	M2
Meropenem	M2 (MS)
Tobramycin	M3
Tigesyklin	M3
Kolistin	M3
Fosfomycin	M3
Imipenem	M3

MS= Screening for resistensmekanismer her ESBL

M3 settes ikke opp rutinemessig, kun ved stammer med <2 følsomme midler.

 

Aeromonas spp har egne brytningspunkter:

Aeromonas spp.
Antibiotika	Lappediffusjon
Trimetoprim-sulfa	M1
Ceftazidim	M1
Ciprofloxacin	M2
Cefepim	M3
Aztreonam	M3
Levofloksacin	M3

 

M3 settes ikke opp rutinemessig, kun ved stammer med <2 følsomme midler.

 

Oppfølgende tiltak i forbindelse med svar, melderutiner

 

NB: Ved mistanke om utbrudd og/eller smitte overført fra næringsmidler, skal alle funn sendes og meldes FHI. Kommuneoverlege og andre instanser skal varsles. Konferer mikrobiolog.

Alle 1. gangs isolater skal:

Mikrobe	Meldes FHI	Sendes FHI	Fryses
Vibrio spp.	JA	JA	JA Boks 5
Shewanella spp.	JA	NEI
Aeromonas spp.	NEI	NEI
Plesiomonas spp	NEI	NEI

 

Definisjon av nytt funn; er > 3 mnd.

ü  Som 1. gangs isolat regnes isolater påvist > 3mnd.

etter siste prøve (gjelder også ved ev. sykdomsresidiv).

Eller ved mistanke om reinfeksjon.

 

Primær-agar oppbevares på benk, i pose, til prøven er blitt identifisert og frosset.

Se også: ALM-MM-Bakt; Varsling, frysing og videresending av bakterieisolat.

 

Svarrapportering

 

Aerob prosedyre skal velges uansett om det er tilgjengelige prosedyrer i Beaker for noen av disse.

 

Dette er pga at vi ikke «tilbyr» denne analysen og har heller ikke tilgang på de riktige selektive medier til denne dyrkningen.

 

Opprett følgende prosedyrer i Beaker for besvarelse av følgende funn	Prosedyre i Beaker
Vibrio spp	Aerob dyrkning
Shewanella spp.
Aeromonas spp.:
Plesiomonas shigelloides (spp.)

 

Funn av Vibrio spp. og Shewanella spp. skal besvares i samråd med mikrobiolog.

 

MERK:

Melding til MSIS overføres automatisk i BEAKER

Kommentaren NMSY skal allikevel legges til i svaret og skal være med ut til rekvirent.

 

Tidligere påvist stamme/isolat/funn av.:

For: Vibrio spp og Shewanella Spp:

V (vekst av)	Legg inn mikrobenavn
.SMITTE	For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer.
.NMSY	Nominativ meldepliktig sykdom
KJ	Kjent fra tidligere

 

Alle nye funn skal ringes til rekvirent. Husk å Legge inn i kom. Logg.

Meldeplikt. Ved nytt funn av

Vibrio spp.:

V (vekst av)	Legg inn mikrobenavn
.SMITTE	For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer.
.NMSY	Nominativ meldepliktig sykdom
.KAR2	Stammen sendes til referanselaboratoriet for nærmere undersøkelse

 

Shewanella spp.:

V (vekst av)	Legg inn mikrobenavn
.SMITTE	For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer.
.NMSY	Nominativ meldepliktig sykdom

 

Ikke meldeplikt ved funn av:

 

Aeromonas spp.:

Dersom følsomhetsbestemmelse gis ut i svaret, slett: Stammen er frosset dersom det er ønskelig med resistenstesting.

 

Plesiomonas shigelloides (spp.):

Dersom følsomhetsbestemmelse gis ut i svaret slett: Stammen er frosset dersom det er ønskelig med resistenstesting.

 

Sending av stammer

 

Alle kliniske førstegangsisolater av Vibrio cholerae og Vibrio parahaemolyticus sendes som renkultur til FHI. Isolater skal sendes inn for videre undersøkelse dersom det ikke med høy sannsynlighet kan utelukkes å være en av de to ovennevnte species. Isolater som påvises ved eventuelt sykdomsresidiv mindre enn 3 måneder etter siste positive prøve skal ikke sendes inn med mindre det foreligger grunn til å mistenke reinfeksjon. Dersom Vibrio cholera eller Vibrio parahaemolyticus isoleres fra ulike prøvematerialer (for eksempel blod eller fæces), bør førstegangsisolatet fra «det klinisk mest alvorlige» materialet sendes inn.

 

Sendes til	Sendes på Copan Eswab m/hvit kork	Stammer som skal sendes
FHI		Alle Vibrio spp SKAL sendes rutinemessig.   Ved mistanke om utbrudd: Aktuell stamme skal da sendes.

 

v  Fyll ut mottakers rekvisisjon.

v  Rekvisisjonen skal scannes inn i rekvisisjonsoppføring.

For HP prøver scannes den inn under resultatregistrering.

 

Rekvisisjon til forsendelse FHI: se under relatert.

Egne adresselapper til FHI er utarbeidet og finnes i folder på vegg rom.nr: B0 63.

For rekvirering og sending av stammer se: ALM-MM-Mottak; Sending av prøver

 

Svar fra FHI

 

Besvares elektronisk.

Besvares under X-Sendeprøve, mikrobiolog, referanselab, svar.

Legg inn svar fra FHI, husk å ta med aktuelle kommentarer som skal være med ut i svarrapport:

Ulike kriterier ved besvarelse fra FHI	KODE UT I SVARRAPPORT	Forklaring av kortkoder
Id bekreftet av referanselaboratoriet	.FBRE	Funnet bekreftet av referanselaboratoriet.
Samsvar av resistens	.REL	Referanselaboratoriets resistenstesting samsvarer med tidligere besvart resistensoppsett.
Avvik av resistenssvar	.RER	Referanselaboratoriets følsomhetstest samsvarer ikke med tidligere besvart følsomhetstest. Referanselaboratoriets svar bør vektlegges tyngst.

 

Alle svar fra FHI skal scannes inn i Beaker:

HP prøver skal scannes inn under resultatregistrering.

Alle andre scannes inn i rekvisisjonsoppføring.

Papirsvar kan kastes i NEI boks etter scanning.