Fæces bør helst tas på Cary Blair medium når prøve sendes fra primærhelsetjenesten og sykehuset Namsos. Hvis prøven er innsendt på glass uten preservering, se prosedyre: ALM-MM-Fæces; Vurdering, innlapping og primærutsæd av fæcesprøver For ev kommentarer som skal være med i svar til rekvirenten
SS/XLD.-agar romtempereres før bruk.
Selenittbuljong oppbevares i romtemperatur ved fæces arbeidstasjon.
SS Agar:
Noen Salmonella- og Shigella-arter kan hemmes på SS-agar. Enkelte Salmonella-arter produserer ikke sorte kolonier. Andre mikroorganismer kan også vokse på dette mediet. Alle suspekte kolonier SKAL identifiseres med Maldi-TOF.
XLD Agar:
Flere forskjellige mikroorganismer kan vokse på X.L.D-agar. Pseudomonas spp. kan vokse som røde kolonier. Proteus spp. kan vokse med sorte/grålige kolonier. Alle suspekte kolonier SKAL identifiseres med Maldi-TOF.
NB: Dersom det er oppgitt i kliniske opplysninger om sterk klinisk mistanke om HUS, SKAL prøven SENDES direkte til STO etter PCR-oppsett. Prøven skal da ikke dyrkes ved SL uavhengig av PCR resultat.
Tabell 1.0 Viser oversikt over utsæd:
Kriterier |
Prøvemateriale |
Medier |
Inkubering |
|
Positiv PCR dagtid |
Fæces (fortrinnsvis med preservering) |
SS/XLD-agar |
Selenittbuljong. |
36°C i inkubator I12
|
Positiv PCR ettermiddag |
Selenittbuljong |
SS/XLD-agar |
|
|
Kontrollprøver |
Fæces (fortrinnsvis med preservering) |
SS/XLD-agar |
Selenittbuljong |
|
Spesiell klinikk |
ALM-MM-Fæces; Vurdering, innlapping og primærutsæd av fæcesprøver |
Videre arbeid/Identifisering:
Tabell 1.1 viser forventet morfologisk oppvekst:
Forventet morfologisk vekst på XLD. Agar |
|
Isolat |
Morfologisk vekst |
Salmonella, Edwardisella spp |
Røde kolonier med sort kjerne. |
Shigella, Providencia, H2S-negative Salmonella spp. |
Røde kolonier |
Escherichia, Enterobacter, Citrobacter, Proteus, Serratia Klebsiella spp. |
Gule/ugjennomsiktige kolonier. |
Forventet morfologisk vekst på SS Agar |
|
Isolat |
Morfologisk vekst |
Salmonella spp |
Gjennomsiktige (farveløse) kolonier med sort kjerne. |
Shigella spp. |
Gjennomsiktige (fargeløse) kolonier |
Proteus spp.og Citrobacter spp. |
Gjennomsiktige (farveløse) kolonier med grå/sort kjerne. |
Etter 1 døgn ved 36°C, vurderes agar.
XLD-Agar: Se etter røde kolonier.
SS-Agar: Se etter gjennomsiktige (farveløse) kolonier.
Alle Suspekte (rosa/røde/sorte/farveløse) kolonier skal identifiseres med Maldi-tof.
Selenittbuljong:
Alle spredninger skal inkuberes i 1 døgn ved 36°C i inkubator I12.
Negativ PCR, men utsæd mtp klinikk:
1. Skåler og buljong skal vurderes selv om det er negativt ved PCR, vurderes som vurdering av SS/XLD-agar og selenittbuljong.
Positiv PCR dagtid:
1. Vurder SS/XLD-agar. Selenittbuljong skal ikke såes ut dersom det er funn på primær-agar.
2. IV eller negativ SS/XLD-agar: Så ut selenittbuljong med blå øse.
3. Dersom spredning med blå øse viser overvekst av annen flora, såes selenittbuljong ut på nytt med 1 µl øse.
Positiv PCR kveld:
1. Så ut selenittbuljong på SS/XLD-agar med blå øse.
2. Dersom det er overvekst av annen flora, såes selenittbuljong ut på nytt med 1 µl øse.
Vurder vekst som beskrevet ovenfor. Vurdering av vekst på SS/XLD agar.
Se også tabell 1.1.
NB: Alle suspekte (rosa/røde/farveløse) kolonier som identifiseres som E. coli og/eller Shigella spp SKAL sendes STO for videre identifisering, da våre metoder (Maldi-Tof) ikke skiller mellom E.coli og Shigella spp./EIEC.
Dersom identifisering er vanskelig må suspekte kolonier renspres til neste dag. Spre da til blod og SS/XLD-Agar. Merk en «dummy» agar, fortrinnsvis en CIN-agar med pasientens etikett, denne skal sjekkes hver dag for svar fra STO.
Aeromonas spp. og Shewanella spp. detekteres ikke ved kjøring på vårt(e) enteric-panel. Dersom ID på suspekte kolonier, se ALM-MM-Fæces; Vibrio spp, Shewanella spp, Aeromonas spp og Plesiomonas shigelloides dyrkning. for videre arbeid.
Alle primære funn skal følsomhetsbestemmes.
Ved funn av Shigella spp. i blodkultur skal isolatet sendes STO for følsomhetsbestemmelse.
Dersom det påvises Shigella spp. på helg/helligdager med ingen transport til STO, så skal følsomhetsbestemmelse utføres og STO må kontaktes ved besvarelse av denne. Kontakt da vakthavende mikrobiolog.
· Medium: MH-agar.
· 0,5 MacFarland i NaCl.
· Lappediffusjon.
Tabell 1.2: Det testes da for følgende midler:
Antibiotika |
Lappediffusjon |
|
Inneliggende |
Primærhelsetj. |
|
ciprofloxacin |
M1 |
M1 |
trimetoprim-sulfa |
M1 |
M1 |
Cefotaxim |
M1 (MS) |
M1 (MS) |
Ceftazidim |
M2 (MS) |
M2 (MS) |
Ceftriakson |
M1 |
M2 |
meropenem |
M2 (MS) |
M2 (MS) |
MS= Screening for resistensmekanismer.
Dersom det må teste for flere M2 og M3 midler, se AFAs anbefalte Resistenspaneler, NB benytt gjeldende versjon.
AFAS anbefalte resistenspaneler
Tolkning ved ESBL se: ALM-MM-Res; ESBL av Enterobacterales, Pseudomonas sp, Acinetobacter sp
Ved mistanke om ESBLCARBA konferer alltid med mikrobiolog.
Alle 1. gangs isolater:
· Meldes elektronisk (inneliggende) og telefonisk (alle) til rekvirent.
· Meldes FHI.
· Skal fryses: Skal føres her: Frysskjema Fryses i boks 5.
· Sendes FHI.
Definisjon av nytt funn:
Som 1. gangs isolat regnes isolater påvist > 3mnd etter siste positive prøve (gjelder også ved ev. sykdomsresidiv), eller ved mistanke om reinfeksjon.
Primær-agar oppbevares på benk, i pose, til prøven er blitt identifisert og frosset.
Se også: ALM-MM-Bakt; Varsling, frysing og videresending av bakterieisolat.
Dersom prøven i tillegg er dyrket mtp spesiell klinikk så skal Shigella dyrkning alltid besvares.
Ved negativ PCR, men oppvekst på dyrkning mtp klinikk, konferer fagansvarlig- eller spesialbioingeniør.
Negativ dyrkning:
Besvares Negativ i kulturfanen.
Negativ dyrkning:
NEG (i kulturfanen).
.STVD (kommer automatisk opp når kulturfanen besvares negativ).
Nytt funn (se definisjon ovenfor):
V
Shigella spp
.SENDSOH
Endelig svar fra St. Olavs skal vektlegges.
.SMITTE
.NMSY
Kontrollprøver:
Tabell 1.3
Positiv |
V |
Shigella spp .SMITTE .KJ |
|
Fjern flagget for meldepliktig. |
|
Negativ |
NEG |
Tabell 1.4 Sending av stammer.
Sendes til |
Sendes på Copan Eswab m/hvit kork |
STO For ID |
|
FHI Referanselab |
v For FHI: fyll ut mottakers rekvisisjon.
v Sending til STO rekvireres i Beaker. Opplys i kommentarfeltet at stammen er sendt ref.lab.
v Rekvisisjonen skal scannes inn i rekvisisjonsoppføring for HP scannes inn i resultatregistrering.
Rekvisisjon til forsendelse FHI: se under relatert.
Egne adresselapper til FHI er utarbeidet og finnes i folder på vegg rom.nr: B0 63.
For rekvirering og sending av stammer se: ALM-MM-Mottak; Sending av prøver
Se også: ALM-MM-Admin; Svarrapportering ved Lab. for medisinsk mikrobiologi.
Endelig svar på spp nivå:
Tabell 1.5: Viser kommentarer som ev skal være med i svarrapport. Kommentaren .FBRE skal alltid ut når svar fra FHI foreligger.
Kriterier ved besvarelse fra FHI |
KODE UT I SVARRAPPORT |
Id bekreftet av referanselaboratoriet |
.FBRE |
Samsvar av følsomhetsbestemmelse |
.REL |
Avvik av følsomhetsbestemmelse |
.RER |
For fæcesprøver:
v Prøvesvar skal resultat korrigeres når svar fra FHI foreligger.
v Når endelig identifisering (til speciesnivå) gis ut se også tabell 1.5 for ev kommentarer som skal ut i tillegg.
For Blodkultur/sterile materialer:
v Prøvesvar skal resultat korrigeres når svar fra FHI foreligger.
v Legg inn fullstendig svar fra FHI. Dersom det er ulikheter på følsomhetsbestemmelse korrigeres dette. Se tabell 1.5.
Svarrapport skal scannes inn i rekvisisjonsoppføring, for HP scannes inn i resultatregistrering.
Papirsvar skal kastes i NEI boks etter scanning.
Tabell 1.6 Viser forklaring av kortkoder:
KODE: |
TEKST: |
.FBRE |
Funnet bekreftet av referanselaboratoriet. |
.GIIA |
Gir infeksjon som vanligvis ikke skal antibiotikabehandles |
.KJ |
Kjent fra tidligere |
.NSMY |
Meldepliktig. |
.REL |
Referanselaboratoriets resistenstesting samsvarer med tidligere besvart resistensoppsett |
.RER |
Referanselaboratoriets følsomhetstest samsvarer ikke med tidligere besvart følsomhetstest. Referanselaboratoriets svar bør vektlegges tyngst. |
.SENDSOH |
Stammen sendes St. Olavs Hospital for videre testing. |
.SMITTE |
For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer. |
.STFR |
Stammen er frosset dersom det er ønskelig med resistensbestemmelse |
.STVD |
Stammen lar seg ikke påvise ved dyrkning. |