Arbeidsbeskrivelse
Intern kvalitetskontroll
|
KONTROLLSTAMME |
SPRES HVER MANDAG |
|
ATCC 49397 Yersinia enterocolitica |
Resultat av vekstkontroll skal føres i skjema som ligger på Teams i mappen kontroller, filnavn: registreringsskjema for daglige og ukentlige kontroller, under fanen SAEN og YEEN.
Ekstern kvalitetskontroll
Med. mikrobiologi er med i SLP/ringtestprogrammet til Folkehelseinstituttet.
Ansvar
Fagbioingeniør faggruppe II, har ansvar for vedlikehold av denne prosedyren. Alle som er opplært i Yersinia-dyrkning har ansvar for å følge denne prosedyren.
HMS/sikkerhetsinformasjon
Andre Yersinia spp. enn Y.pestis klassifiseres i smitterisikogruppe 2. Y.pestis klassifiseres i smitterisikogruppe 3. Utsåing av fæcesprøver, spredning av selenitt (giftig ved innådning), og etterarbeid (avlesning av skålene, identifisering mm) skal gjøres i Sikkerhetsbenk. Ta på munnbind, smittefrakk, og benytt hansker.
Arbeidets gang
Prøvematerialet og bearbeidelse av dette
Fæces bør helst tas på Cary Blair medium når prøve sendes fra primærhelsetjenesten og sykehuset Namsos. Hvis prøven er innsendt på glass uten preservering, se prosedyre: ALM-MM-Fæces; Vurdering, innlapping og primærutsæd av fæcesprøver for kommentarer som skal skrives i svar til rekvirenten.
Analyseutstyr og klargjøring av disse
ALM-MM-Mottak; Valg av medier ved utsåing av bakteriologiske prøver
ALM-MM-Fæces; Vurdering, innlapping og primærutsæd av fæcesprøver
Feilkilder og interferens
For høy temperatur kan føre til overvekst av andre Gram negative staver.
Utsådde prøver med rikelig vekst innen 20-24 timer må ikke stå inkubert i mer enn 1 døgn. Kolonienes egenskaper forringes ved overinkubering. I helger/høytider, dersom det ikke blir tid til å vurdere skålene, skal skålene settes i kjøleskap etter 1 døgns inkubasjon. Skålene pakkes da i plastpose.
Unntak: Skåler uten vekst/sparsom/moderat vekst reinkuberes inntil 24 timer.
Fremgangsmåte/Utførelse av analysen
Videre arbeid/identifisering
1. døgn:
CIN-agar:
Etter 1 døgns inkubering vurderes CIN-agar:
NB: Ved ingen vekst/sparsom/moderat vekst reinkuberes agar inntil 24 timer.
Yersinia spp vokser på CIN-skål som små blanke kolonier med rødt senter (okseøye).
Spre kolonier som ikke er lactosefermenterende til MacConkey-agar (og ev. CIN-skål). Ved god artsidentifikasjon på Maldi-TOF skal stammen ren-spres på MacConkey-agar for sending og frysing.
Identifikasjon til artsnivå er essensielt for vurdering av patogenisitet.
• Tydelige E.coli, Klebsiella species osv. avskrives.
• Stammer som ikke er lactosefermenterende, ev. stammer som blir svakt rødfarget på MacConkey-agar, arbeides det videre med.
• Yersinia er ubevegelig ved 37°C og bevegelige ved romtemperatur.
Videre arbeid bestemmes ut i fra hvilken Yersinia species Maldi-TOF resultat gir:
• Yersinia enterocolitica:
Stammen sendes SOH for å skille mellom patogen og apatogen variant og evt. følsomhetsbestemmelse dersom patogen variant fra innlagt pasient.
• Yersinia pseudotuberculosis eller Yersinia pestis:
• MALDI-TOF skiller ikke mellom Y. pseudotuberculosis og Y. pestis. NB PRØVEN skal da sendes SOH for identifisering og evt. følsomhetsbestemmelse (for sending se under «Sending av Prøver/stammer»). Det skal ikke gjøres videre arbeid og mikrobiolog skal varsles.
• Y. fredriksenii, Y. kristensenii, Y. ruckeri, Y. mollaretii, Y. bercovieri, Y. rohdei, Y. aldovae eller Y. intermedia:
De regnes som apatogene. Vurder ny MALDI-TOF
på andre suspekte kolonier. Kan være flere typer som vokser.
Selenitt:
NB! Ved oppvekst av Yersinia pseudotuberculosis eller Yersinia pestis på CIN-agar fra primær utsæd, skal Selenitt ikke såes ut!
Etter 1 døgn spres Selenitt-buljongen med blå-øse til CIN-agar merket med Yersinia selenittbuljong og inkuberes videre i 1 døgn. Spredning fra selenitt vurderes likt som CIN-agar fra primær utsæd.
Følsomhetsbestemmelse
Følsomhetsbestemmelse utføres kun på primære funn av Y. enterocolitica for inneliggende pasienter, men skal ikke ut i svarrapport (unntak: ønske fra rekvirent).
Følsomhetsbestemmelse på primære funn av Y. pseudotuberculosis og Y.pestis utføres ved St. Olavs.
• Oppsett på MH-agar, lappediffusjon
• 0,5 McFarland i NaCl
Midler det skal testes på:
|
Antibiotika |
lappediffusjon |
|
ciprofloxacin |
M2 |
|
trimetoprim-sulfa |
M1 |
|
cefotaxime |
MS |
|
ceftazidime |
MS |
|
meropenem |
MS |
MS= Screening for resistensmekanismer.
Ved besvarelse med følsomhetsbestemmelse konferer alltid med
mikrobiolog.
Tolkning ved ESBL se: ALM-MM-Res; ESBL av Enterobacterales, Pseudomonas sp, Acinetobacter sp
Ved mistanke om ESBLCARBA konferer alltid med mikrobiolog.
Oppfølgende tiltak i forbindelse med svar, melderutiner
Alle 1. gangs isolater skal:
• Meldes elektronisk (skriftlig) og telefonisk til rekvirent.
• Meldes FHI.
•
Alle funn skal fryses. Skal føres her:
Frysliste: I:\HNT - ALM Fellesområde\Driftsenheter\MM\Fryslister, legges i boks
5.
• Sendes SOH for agglutinasjon av serotype.
• SOH videresender isolatet til FHI.
Definisjon av nytt funn er > 3 mnd.
Som 1. gangs isolat regnes også isolater som påvises ved ev. sykdomsresidiv
mer enn ca. 3mnd etter siste positive prøve eller hvis det for øvrig skulle
foreligge grunn til å mistenke reinfeksjon.
Primær-agar oppbevares på benk, i pose, til prøven er blitt identifisert og frosset ned.
Svarrapportering
Generelt for besvarelse på diaréfremkallende agens; Når ingen diaréfremkallende agens er påvist ved dyrkning av prøven, ta med følgende kommentar til kliniker:
.BEGDIA: Begrenset diagnostikk er utført. Ved fortsatt mistanke om infeksjon, anbefales ny prøve. Ev ny prøve vil videresendes SOH for utvidet PCR-analyse.
Kommentaren skal altså KUN ut til kliniker dersom negativ dyrkning på alle parameter i dyrkningspakken.
Er prøven i tillegg sendt til SOH, skal kommentaren ikke ut.
Kommentaren skal legges inn i rekvisisjonsoppføring under fanen rekv.kommentar.
Negativ dyrkning:
NEG: Negativ.
Tidligere påvist Yersinia spp:
|
V (vekst av) |
Legg inn mikrobenavn |
|
.SMITTE |
For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer. |
|
.KJ |
Kjent fra tidligere |
Nytt funn av Yersinia spp:
Alle nye funn skal sendes SOH
Alle nye patogene funn skal ringes til rekvirent. Husk å legge inn i kom. Logg.
MERK:
Melding til MSIS overføres automatisk i BEAKER
Primære Y. enterocolitica funn
|
V (vekst av) |
Legg inn mikrobenavn |
|
.GIIA |
Gir infeksjon som vanligvis ikke skal antibiotikabehandles. |
|
.SMITTE |
For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer. |
|
.SENDSOH |
Stammen sendes St.Olavs Hospital for agglutinasjon av serotype. |
|
|
Endelig svar fra St. Olavs skal vektlegges. |
|
.NMSY |
Nominativt meldepliktig sykdom |
Primære Y. pseudotuberculosis funn
|
V (vekst av) |
Yersinia spp. |
|
.GIIA |
Gir infeksjon som vanligvis ikke skal antibiotikabehandles. |
|
|
Påvist patogen variant. Stammen sendes St.Olavs Hospital for videre identifisering. |
|
.SMITTE |
For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer. |
|
|
Endelig svar fra St. Olavs skal vektlegges. |
|
.NMSY |
Nominativt meldepliktig sykdom |
Ved besvarelse av følsomhetstesting skal kommentaren GIIA ikke ut i svarrapport.
Primære funn av andre Yersinia enn Y. pseudotuberculosis og Y. enterocolitica
|
V (vekst av) |
Legg inn mikrobenavn |
|
Regnes som apatogen |
|
|
Fjern meldeplikt. |
|
Sending av prøvemateriale/stammer
|
Sendes til |
Sendes på |
Ved ID Maldi-tof: |
|
SOH |
|
Prøvemateriale sendes SOH |
* Ved mistanke om oppvekst av Y.pestis:
• Prøvemateriale skal sendes SOH. Kontakt vakthavende mikrobiolog ved SOH før sending. Transport av prøven gjøres i kategori B som de aller fleste biologiske materialer.
•
Prøvemateriale pakkes inn i parafilm som igjen pakkes inn i flere
poser som igjen forsegles med tape.
NB!:Selve skålene skal ikke sendes SOH,
da transport av bakteriekultur som klassifiseres i smitterisikogruppe 3 må
gjøres i kategori A
Se: ALM-MM-; Hygiene og sikkerhetsrutiner på Lab. for med. mikrobiologi
SOH videresender ev funn av Yersinia spp. til FHI.
For rekvirering og sending av stammer se: ALM-MM-Mottak; Sending av prøver