Arbeidsbeskrivelse
Ansvar
v Levanger: Fagbioingeniør Genteknologisk seksjon har fagansvaret for instrumentet. Med. Mikrobiologi (MM) har ansvar for vedlikehold av instrumentet og hovedansvar for analysering av prøvene i deres åpningstid. Medisinsk Biokjemi analyserer prøver utenom MM`s åpningstid.
v Namsos: Fagbioingeniør preanalytisk har fagansvaret for instrumentet. Medisinsk Biokjemi har ansvar for vedlikehold av instrumentet og analysering av prøvene i henhold til egne rutiner.
v Levanger og Namsos: Alle ansatte som er opplært og utfører analysen har ansvar for å følge prosedyren.
HMS/sikkerhetsinformasjon
HMS-datablad for reagensene finnes i EcoOnline.
Hvert kit inneholder:
|
Reagens |
Mengde pr prøvekassett |
|
Bead 1, Bead 2 og Bead 3 (frysetørket) |
1 av hver |
|
Reagens 1 |
3,0 mL |
|
Reagens 2 (Natrium hydoxid) |
3,5 mL |
|
Elution reagens |
2,0 mL |
Siden humant materiale benyttes vil det alltid være en risiko for infeksjon. For å unngå kontaminering og infeksjon bør man alltid følge en standard sikkerhetsprosedyre ved håndtering av potensielt infeksiøst materiale: ALM-MM-; Hygiene og sikkerhetsrutiner på Lab. for med. mikrobiologi
v Alt arbeid med prøvene skal foregå i sikkerhetsskap klasse 2.
v Bruk smittefrakk og hansker ved alt arbeid med prøvene.
v Ved oppsett av flere prøver, skift hansker mellom hver pasientprøve.
v Når prøven er tilsatt kassetten, kast avfallet i smitteboksen/risikoavfall.
v Bruk hansker i vaskeprosessen.
v Vask/tørk av pipetten med overflatesprit.
Arbeidets gang
Spesielle forhold vedrørende prøvetaking og prøvemateriale
Oversikt over godkjent prøvemateriale
1. Prøve tatt fra nese (rett innenfor nesevingene-samme prøvepinne benyttes i begge nesebor.)
2. Prøve fra hals (ikke validert av produsenten, men skal likevel analyseres på GeneXpert)
3. Prøve tatt fra kun hals eller kun nese må kommenteres (se tabell 3)
Oversikt over aktuelle prøvemedium
1. Copan e-swab.
Godkjent farge på kork; Hvit, rosa, oransje og blå.
2. Virustransportmedium (rød kork)-se tabell 3.
Tabell 3: Kommentarer
|
Avvik |
Kommentar |
|
Mottatt prøve kun fra hals evt kun fra nese |
.TMSK (Til MRSA screening kreves prøve fra hals, nese og perineum)* |
|
Mottatt prøve tatt på Virustransportmedium (VTM) (Rød kork) |
Prøve avvises. Avbrytelsesårsak: Feil prøvebeholder mottatt (Kode 36) |
*Kommentar legges inn av MM-Levanger før utsåing av prøver.
I tillegg til å kjøre hurtigtest, skal prøvene dyrkes.
v For MM: Påvisning av MRSA med cromagarskål ALM-MM-Puss; Screening og påvisning av methicillinresistent S.aureus (MRSA) og methicillinresistent S.argenteus
v For MB-Levanger: Utsåing av MRSA-prøver utenom MMs ordinære åpningstider ALM-MM-Mottak; Utsåing av MRSA-prøver utenom MMs ordinære åpningstider. og Dokumentasjonsliste, Signering for utsåing av mikrobiologiske prøver ved bruk av reservenummer {{EQSDokument 23515}}
v For MB-Namsos: Prøvene sendes til MM-Levanger for utsåing.
Ofte stilte spørsmål (FAQ)
v Hva gjøres om prøven er tatt på transportmedium med rød kork?
ü Rød kork brukes til virus analyser og molekylære/PCR analyser.
ü Prøver med rød kork kan brukes til GeneXpert, men ikke til dyrkning. Prøven må avvises for både hurtigtest og dyrkning siden prøvematerialet skal være det samme ved hurtigtest og dyrkning.
ü Avbryt dyrkning og hurtigtest med kommentaren: Feil prøvebeholder mottatt (Kode 36).
v Hvordan tas prøvene til screening (dyrkning og hurtigtest)?
ü Det skal benyttes Copan prøvepinne.
ü Neseprøve: Samme pensel brukes i begge nesebor. Før penselen 1 cm innenfor neseboret og stryk innsiden av nesevingen 3 ganger. Sett penselen direkte tilbake i røret uten at den berører ytterkanten av prøveglasset. Brekk av plast-pinnen ved den rosa streken slik at korken kan skrus på glasset.
ü Halsprøve: Stryk penselen 3 ganger over tonsiller, bakre ganeseil og bakre svelgvegg. Sett penselen direkte tilbake i røret uten at den berører ytterkanten av prøveglasset. Brekk av plast-pinnen ved den rosa streken slik at korken kan skrus på.
ü Husk å merke prøveglassene med prøveetikett.
v Hvor lang tid tar det før svaret foreligger?
Analysetiden er i overkant av 1 time. Svartiden kan bli 1,5-2 timer på grunn av forarbeid, besvarelse og kapasitet. Hvis det kommer mange prøver samtidig og ved høy arbeidsmengde, kan svartiden bli noe lenger.
Reagenser og klargjøring av disse
Reagenskit:
Leverandør: Cepheid
GXMRSA-NxG-CE-10
10 stk prøvekassetter
Analysekassett skal ha romtemperatur.
Levanger: Esken med analysekassetter og Elution rgt står på benken ved siden av avtrekkskapet. Der skal også sterile pipetter samt pipette og pipettespisser være.
Namsos: Utstyr finnes i skuffene til høyre for avtrekkskapet.
Analyseutstyr og klargjøring av disse
GeneXpert skal alltid være påslått.
Rekvirering av prøver:
v RoS:
Se ALM-IKT; Rekvirering av laboratorieprøver i RoS
v Beaker:
Se ALM-MM; Mottak av prøver, aksept eller avvisning og ALM-MM-Mottak; Mottak, innregistrering og utsåing (Ikke tilgjengelig)
Prøvemedium: Se Oversikt over aktuelle prøvemedium.
Usikkerhetsbidrag, feilkilder og interferens
Interfererende substanser er blod, slim og eventuelt bruk av nesespray og lignende.
For utfyllende informasjon om begrensninger se pakningsvedlegg (under Relatert)
Fremgangsmåte/Utførelse av analysen
v Prøvene skal være romtemperert.
v Hals- og neseprøve skal analyseres hver for seg.
v Preparering og utsåing av prøvene skal gjøres i godkjent avtrekksskap (klasse 2).
v Bruk smittefrakk og hansker!
v Hvis det er prøver fra flere pasienter; skift hansker mellom hver pasientprøve (ikke mellom hals- og neseprøve fra samme pasient).
1. Prøvene mottak-registreres i «Mottak»
2. Vortex prøverøret i min. 10 sekunder.
3. Tilsett 300 µL fra det flytende mediet i prøverøret til Eluation rgt med ei pipette.
4. Vortex Elution Rtg i min. 10 sekunder.
5. Åpne lokket til prøvekassetten.
6. Bruk ei steril pipette og overfør all væsken fra Elution Rtg til prøvekassetten gjennom det store hullet (Sample Chamber) (se fig. 1).
Fig.1
7. Lukk lokket på prøvekassetten.
8. Merk prøvekassetten med den lille etiketten (se fig. 2), men den må IKKE settes på QR-koden.
NB! Det vil være et lab.nr for hals- og et lab.nr for neseprøven. IKKE benytt Chromagar-etiketten. (Da vil ikke analyseresultatet overføres til Beaker.)
Fig.2
NB! Husk å vask over arbeidsflaten, ta av hansker og smittefrakk, knyt igjen søppelposen som er benyttet inne i avtrekkskapet og kast denne i risikoavfallsbøtte når du er ferdig med prepareringen.
9. Gå til instrumentet og pc’en. GeneXpert skal alltid være påslått.
På skjermen vil skrivebordet se slik ut (OBS! Kammer A4 mangler):
Ordinær kjøring av instrumentet
- Trykk på «Create test»
- Scan barkoden til prøven. (Velg «Manual entry» og skriv inn fødselsnr. hvis det mangler barkode. For kontroller – skriv inn navnet på kontrollen.) Scan barkoden på kassetten.
- Trykk «Start test». Det vil da blinke grønt over det kammeret du skal bruke. Sett kassetten inn i instrumentet (strekkoden skal vende framover). Lukk luka. Du vil høre et klikk. Testen starter, og det grønne lyset vil slutte å blinke.
- Analysen starter, og «Progress loading» vil komme opp på skjermen ved aktuelt kammer. Etter ei kort stund vil det komme opp når en kan forvente at analysen er ferdig.
- Når det grønne lyset slukker er analysen ferdig. Du kan se resultatet ved å trykke «View results» på menylinja.
Kontroller at «Sample ID» (Felt nest øverst til venstre) er identisk med det prøvenummeret du la inn.
Alternativt kan man trykke på «View Test» på nederste linje, for så å velge riktig prøvenummer. Bildet skal da se slik ut:
Her står Prøve ID, resultat, Assay (type kit), status, startdato/klokkeslett. Ved å velge «Sample ID» og trykke OK vil skjermbilde skifte til «View Results».
Når analysen er ferdigkjørt legges prøvekassetten i en pose og kastes i risikoavfall.
Trykker man «Stop Test» vil analysen avsluttes, og kassetten kan ikke settes inn igjen.
Vurdering
Det er ikke nødvendig å vurdere ct-verdiene før prøven besvares.
Kliniker kan få Ct-verdien hvis det er ønskelig, men ikke gi ut Ct-verdi hvis prøven er negativ.
Svarrapportering
Tabell 4: Analyseresultat
|
Resultat |
Svar i Beaker |
|
MRSA DETECTED |
Positiv Positivt resultat vil bli bekreftet med dyrkning. |
|
MRSA NOT DETECTED |
Negativ |
|
ERROR Prøven må retestes* |
Hvis ERROR etter retesting besvares prøven .DYRKMRSA (Usikkert resultat, avvent svar på dyrkning). |
*Prøven må settes opp på nytt fra pkt 2 under Fremgangsmåte/Utførelse av analysen.
Tabell 5: Varslerutiner ved positiv MRSA
|
Resultat |
Varsle |
|
MRSA positiv |
· Rekvirerende avdeling telefonisk · Dagtid mandag-fredag: Seksjonsleder MB · Lørdag/søndag/helligdag: Muntlig beskjed til vaktpersonale MB. · Smittevern: Ø Levanger: Anne Gro Fjellingsdal Ø Namsos: Anne Berit Lysberg Brønlund Ø Dagtid mandag-fredag: Telefonisk Ø Ettermiddag/kveld/natt/helg/helligdager: E-post med tittel: Positiv MRSA-hurtigtest NB! Oppgi kun lab.nr og aktuell avd i e-post-ikke andre pasientopplysninger. |
v Resultatet går over automatisk i Beaker, men prøvene må verifiseres.
Ø Det kan legges inn ct-verdi på X-S.aureus mecA gen, S-SCC kontroll og X-SPC kontroll, men dette er ikke nødvendig. Hvis ikke det blir lagt inn Ct-verdiene, godta advarslene som kommer opp og fullfør verifiseringen.
v Ved positivt resultat: Husk å ringe til rekvirerende avdeling og legg inn i Komm.log at det er ringt og hvem som har tatt imot beskjeden.
Vedlikehold