Sapovirus RNA (fæces) v. 1.2

Indikasjoner

-          Mistenkt gastroenteritt med symptomvarighet inntil 3 dager uavhengig av pasientens alder.

-          Testen utføres på avføringsprøver fra symptomatiske pasienter med mistanke om akutt gastroenteritt, enteritt eller kolitt.

-          PCR anbefales ikke brukt rutinemessig for å vurdere smittefare og behov for eventuell isolasjon i dagene etter symptomfrihet.

-          Sapovirus-PCR kan påvise selv meget små mengder virus-RNA etter avsluttet sykdom, selv om smittefaren er minimal.

 

Prøvetaking (materiale)/transport

Det skal alltid sendes to prøver til lab; (se også ALM-MM-Mottak; Prøvetakingsveileder)

Avføringsprøve bør tas innen tre døgn etter sykdomsstart.

Vår metode kan ikke utføre analysen fra oppkast. Prøve vil da bli videresendt til St. Olavs Hospital for analysering.

 

Prøve tatt på universalcontainer med skje

 

Prøveglass med brun kork og universalcontainer uten skje (med hvit kork) godtas også.

 

Et bilde som inneholder tekst, flaske, vannflaske, innendørs KI-generert innhold kan være feil.

Prøve tatt på Copan fecal swab med Cary Blair medium

Et bilde som inneholder Medisinsk utstyr, Laboratorieutstyr, sprøyte, medisinsk KI-generert innhold kan være feil.

Tabell 1: Transportmedium

Raskest mulig transporttid til laboratoriet. Dersom prøven ikke kan leveres umiddelbart til laboratoriet, bør den oppbevares i kjøleskap til forsendelse.

 

Prøven er holdbar:

-          Opptil 120 timer (5 døgn) ved 2°C-8°C.

-          Maksimalt 48 timer ved 2°C-25°C.

Temperatur under transport til laboratoriet må være 2°C-25°C. Prøven må beskyttes mot frost og eksponering for høy temperatur.

 

Forventet svartid

Analysen utføres alle hverdager, i åpningstiden til Med. mikrobiologisk lab.

På helg- og helligdager vil analysen bli utført etter gitte kriterier.

Analysetiden er ca. 3 timer.

Alle positive resultat vil bli gitt telefonisk til rekvirerende sykehus-/institusjonsavdeling.

 

Referanseområde

Negativ

 

Tolkning

Resultat

Prøven besvares

Positiv

Genmateriale fra Sapovirus påvist.

For smittevern, se folkehelseinstituttets smitteveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer.

Negativ

Negativ

Inkonklusiv

Inkonklusiv

Ny prøve anbefales ved mistanke om virusinfeksjon.

Tabell 2: Tolkning av svar

 

Merknader

Dette er en kombinert test som vil kunne påvise Sapovirus genotype I, II, IV eller V i tillegg til Humant Astrovirus (hAstro), Rotavirus A, Norovirus GI og GII og Adenovirus F40/F41 fra samme prøve.

Vår metode kan påvise Sapovirus genotype I, II, IV eller V, men den skiller ikke mellom artene.

 

Nyttige lenker

Norovirus og Sapovirus-enteritt - FHI

 

Metode

Testen blir utført direkte fra avføringsprøven ved bruk av polymerasekjedereaksjon (PCR) i sanntid for oppformering av relevant genmål-RNA for Sapovirus.

Testen benytter hybridiseringsprober som er spesifikke for fluorogene gener, til påvisning av oppformert RNA.

 

Analyseinstrument: BD MAX fra Becton, Dickinson and Company (BD).

 

Metoden er ikke akkreditert.

 

Norsk laboratoriekode

NPU27649: F-Sapovirus RNA