Rotavirus A RNA (fæces) v. 1.3

Indikasjoner

-          Gastroenteritt hos barn og immunsvekkede pasienter.

-          PCR anbefales ikke brukt rutinemessig for å vurdere smittefare og behov for eventuelt isolasjon i dagene etter symptomfrihet.

-          Rotavirus-PCR kan påvise meget små mengder virus RNA etter avsluttet sykdom, selv om smittefaren er minimal.

 

Prøvetaking (materiale)/transport

Det skal alltid sendes to prøver til lab; (se også ALM-MM-Mottak; Prøvetakingsveileder)

Prøve tatt på universalcontainer med skje

 

Prøveglass med brun kork og universalcontainer uten skje (med hvit kork) godtas også.

 

Et bilde som inneholder tekst, flaske, vannflaske, innendørs KI-generert innhold kan være feil.

Prøve tatt på Copan fecal swab med Cary Blair medium

Et bilde som inneholder Medisinsk utstyr, Laboratorieutstyr, sprøyte, medisinsk KI-generert innhold kan være feil.

Tabell 1: Transportmedium

Raskest mulig transporttid til laboratoriet. Dersom prøven ikke kan leveres umiddelbart til laboratoriet, bør den oppbevares i kjøleskap til forsendelse.

 

Prøven er holdbar:

-          Opptil 120 timer (5 døgn) ved 2°C-8°C.

-          Maksimalt 48 timer ved 2°C-25°C.

Temperatur under transport til laboratoriet må være 2°C-25°C. Prøven må beskyttes mot frost og eksponering for høy temperatur.

 

Forventet svartid

Analysen utføres daglig, i åpningstiden til Med. mikrobiologisk lab.

På helg- og helligdager vil analysen bli utført etter gitte kriterier.

Analysetid er ca. 3 timer.

Alle positive resultat vil bli gitt telefonisk.

 

Referanseområde

Negativ

 

Tolkning

Resultat

Prøven besvares

Positiv

Genmateriale fra Rotavirus A påvist. Prøven sendes SOH for undersøkelse om isolatet er vaksinestamme eller villtype.

For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer.

MSIS-melding-klinikermelding skal sendes. Hvis ikke klinikermelding er sendt tidligere, skal rekvirerende lege sende elektronisk klinikermelding (https://klinikermelding.fhi.no) eller utfylt meldingsskjema (https://www.fhi.no/msis) per post.

Negativ

Negativ

Inkonklusiv

Inkonklusiv

Ny prøve anbefales ved mistanke om virusinfeksjon.

Tabell 2: Tolkning av svar

 

Merknader

Dette er en kombinert test som vil kunne påvise Rotavirus A i tillegg til Adenovirus F40/F41, Norovirus GI og GII, Sapovirus (genotyper I, II, IV og V) og Humant Astrovirus (hAstro) fra samme prøve.

Vår metode skiller ikke mellom vill- og vaksinestamme. Positive prøver vil derfor videresendes til SOH for videre analysering.

 

Nyttige lenker

Brukerhåndbok i medisinsk mikrobiologi (DNL)

Rotavirussykdom - FHI

Meldingskriterier for sykdommer i MSIS - FHI

 

Metode

Testen blir utført direkte fra avføringsprøven ved bruk av polymerasekjedereaksjon (PCR) i sanntid for oppformering av relevant genmål-RNA for Rotavirus A.

Testen benytter hybridiseringsprober som er spesifikke for fluorogene gener, til påvisning av oppformert DNA.

Analyseinstrument: BD MAX fra Becton, Dickinson and Company (BD).

 

Metoden er ikke akkreditert.

 

Norsk laboratoriekode

NPU27845: F-Rotavirus RNA