Rotavirus A RNA (fæces) v. 1.2

Indikasjoner

v  Gastroenteritt hos barn og immunsvekkede pasienter.

v  PCR anbefales ikke brukt rutinemessig for å vurdere smittefare og behov for eventuelt isolasjon i dagene etter symptomfrihet.

v  Rotavirus-PCR kan påvise meget små mengder virus RNA etter avsluttet sykdom, selv om smittefaren er minimal.

Prøvetaking (materiale)/transport

v  Det skal alltid sendes to prøver til lab;

Ø  Prøve tatt på universalcontainer med skje (Figur 1).

 

Figur 1

 

Prøveglass med brun kork og universalcontainer uten skje (med hvit kork) godtas også.

 

Ø  Prøve tatt på Copan fecal swab med Cary Blair medium (Figur 2).

 

Figur 2

 

NB! Husk å merke prøverøret med navn og fødselsnummer.

Raskest mulig transporttid til laboratoriet. Dersom prøven ikke kan leveres umiddelbart til laboratoriet, bør den oppbevares i kjøleskap til forsendelse.

Prøven er holdbar:

v  Opptil 120 timer (5 døgn) ved 2°C-8°C.

v  Opptil 48 timer ved 2°C-25°C.

v  Temperatur under transport til laboratoriet må være 2°C-25°C. Prøven må beskyttes mot frost og eksponering for høy temperatur.

Forventet svartid

Analysen utføres daglig, i åpningstiden til Med. mikrobiologisk lab.

På helg- og helligdager vil analysen bli utført etter gitte kriterier.

Analysetid er ca 3 timer.

Alle positive resultat vil bli gitt telefonisk.

Referanseområde

Negativ

 

Tolkning

Prøvene besvares:

v  Postive: Positiv.

Genmateriale fra Rotavirus A påvist. Prøven sendes SOH for undersøkelse om isolatet er vaksinestamme eller villtype.

For smittevern, se Folkehelseinstituttets smittevernveileder og/eller helseinstitusjonens egne smittevernprosedyrer.

MSIS-melding-klinikermelding skal sendes. Hvis ikke klinikermelding er sendt tidligere, skal rekvirerende lege sende elektronisk klinikermelding (https://klinikermelding.fhi.no) eller utfylt meldingsskjema (https://www.fhi.no/msis) per post.

v  Negative: Negativ

 

Merknader

Dette er en kombinert test som vil kunne påvise Rotavirus A i tillegg til Adenovirus F40/F41, Norovirus GI og GII, Sapovirus (genotyper I, II, IV og V) og Humant Astrovirus (hAstro) fra samme prøve.

Vår metode skiller ikke mellom vill- og vaksinestamme. Positive prøver vil derfor videresendes til SOH for videre analysering.

 

Nyttige lenker

v  Brukerhåndbok i medisinsk mikrobiologi (DNL)

v  Rotavirussykdom - FHI

v  Meldingskriterier for sykdommer i MSIS - FHI

Metode

Testen blir utført direkte fra avføringsprøven ved bruk av polymerasekjedereaksjon (PCR) i sanntid for oppformering av relevant genmål-RNA for Rotavirus A.

Testen benytter hybridiseringsprober som er spesifikke for fluorogene gener, til påvisning av oppformert DNA.

Analyseinstrument: BD MAX fra Becton, Dickinson and Company (BD).

 

Metoden er ikke akkreditert.

 

Norsk laboratoriekode

NPU27845: F-Rotavirus RNA